Menjadi institusi tunggal maka BAN-PT memiliki wewenang menjalankan proses akreditasi terhadap pendidikan tinggi. Wewenang tersebut mencakup pula akreditasi terhadap seluruh lembaga pendidikan tinggi mulai Perguruan Tinggi Negeri, Perguruan Tinggi Swasta, Perguruan Tinggi Agama sampai Perguruan Tinggi Kedinasan. GudangIlmuFarmasi – Hingga tanggal 26 September 2016, 26 Perguruan Tinggi telah membuka Program Studi Apoteker yang terakreditasi BAN PT (Badan Akreditasi Nasional Pendidikan Tinggi).
Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi (BAN-PT) berdiri pada tahun 1994 merupakan satu-satunya badan akreditasi yang diakui oleh pemerintah Republik Indonesia (dalam hal ini oleh Kementerian Riset Teknologi Dan Pendidikan Tinggi Republik Indonesia). BAN-PT merupakan lembaga yang mempunyai fungsi penilaian mutu perguruan tinggi, meliputi Perguruan Tinggi Negeri dan Swasta. Berikut adalah hasil akreditasi yang telah dilakukan oleh BAN-PT terhadap program studi yang ada di Fakultas Ekonomika dan Bisnis Universitas Gadjah Mada: No Jenjang Program Studi No SK Masa Berlaku Peringkat 1.